Parallelization of Gillespie algorithm based on binary words

محفوظ في:
التفاصيل البيبلوغرافية
الحاوية / القاعدة:arXiv.org (Dec 21, 2024), p. n/a
المؤلف الرئيسي: Lacoste, David
مؤلفون آخرون: Castellana, Michele
منشور في:
Cornell University Library, arXiv.org
الموضوعات:
الوصول للمادة أونلاين:Citation/Abstract
Full text outside of ProQuest
الوسوم: إضافة وسم
لا توجد وسوم, كن أول من يضع وسما على هذه التسجيلة!
الوصف
مستخلص:We present an improvement of the Gillespie Exact Stochastic Simulation Algorithm, which leverages a bitwise representation of variables to perform independent simulations in parallel. We show that the subsequent gain in computational yield is significant, and it may allow to perform simulations of non-well mixed chemical systems. We illustrate this idea with simulations of Frank model, originally introduced to explain the emergence of homochirality in prebiotic systems.
تدمد:2331-8422
المصدر:Engineering Database