Parallelization of Gillespie algorithm based on binary words

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Опубліковано в::arXiv.org (Dec 21, 2024), p. n/a
Автор: Lacoste, David
Інші автори: Castellana, Michele
Опубліковано:
Cornell University Library, arXiv.org
Предмети:
Онлайн доступ:Citation/Abstract
Full text outside of ProQuest
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Опис
Короткий огляд:We present an improvement of the Gillespie Exact Stochastic Simulation Algorithm, which leverages a bitwise representation of variables to perform independent simulations in parallel. We show that the subsequent gain in computational yield is significant, and it may allow to perform simulations of non-well mixed chemical systems. We illustrate this idea with simulations of Frank model, originally introduced to explain the emergence of homochirality in prebiotic systems.
ISSN:2331-8422
Джерело:Engineering Database